فایل ورد کامل مقاله علمی درباره مطالعه فیلوژئوگرافی DNA کلروپلاست گونه راش (Fagus orientalis Lipsky) در جنگل‌های ایران

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

 فایل ورد کامل مقاله علمی درباره مطالعه فیلوژئوگرافی DNA کلروپلاست گونه راش (Fagus orientalis Lipsky) در جنگل‌های ایران دارای ۱۲ صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است

فایل ورد فایل ورد کامل مقاله علمی درباره مطالعه فیلوژئوگرافی DNA کلروپلاست گونه راش (Fagus orientalis Lipsky) در جنگل‌های ایران  کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه  و مراکز دولتی می باشد.

توجه : در صورت  مشاهده  بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی فایل ورد کامل مقاله علمی درباره مطالعه فیلوژئوگرافی DNA کلروپلاست گونه راش (Fagus orientalis Lipsky) در جنگل‌های ایران،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

---

بخشی از متن فایل ورد کامل مقاله علمی درباره مطالعه فیلوژئوگرافی DNA کلروپلاست گونه راش (Fagus orientalis Lipsky) در جنگل‌های ایران :

مقدمه

DNA کلروپلاســت (cpDNA) بــه شــدت محافظــت شــده مــیباشــد و دارای میــزان جهــش کمتــری از تـوالیهـای DNA در ژنـوم هسـتهای گیـاه اسـت .(۲)

بطـــوری کـــه در برخـــی گیاهـــان از جملـــه راش، گونــاگونی بدســت آمــده بــرای ســاختن فیلــوژنی درون گونــهای و ایجــاد ارتبــاط ایــن فیلــوژنی بــا توزیـــع جغرافیـــایی هاپلوتایـــپهـــا کـــافی اســـت

۳)،۴،۱۶،۱۷،.(۱۸ بـــا توســـعه روشهـــای مولکـــولی، امکــان بررســی گونــاگونی جغرافیــایی بــا اســتفاده از نشــــانگرهای ملکــــولی و شــــناخت ســــاختارهای فیلوجغرافیـــایی درون گونـــهای بـــه وجـــود آمـــده اســت .(۸) فیلوجغرافیــایی درون گونــهای کــه توســط Avise و همکــــاران در ۱۹۸۷بــــه عنــــوان مطالعــــه روابـط بـین فیلـوژنی آللهـا و توزیـع جغرافیـاییشـان تعریــف شــده در علــم تکامــل کاربردهــای بســیاری پیــدا کــرده اســت .(۱۱) مطالعــات متعــددی در مــورد گونـــاگونی جغرافیـــایی در خـــانواده Fagaceae بـــا اســـتفاده از نشـــانگرهای ملکـــولی cpDNA انجـــام شـــده اســـت ۲۲)،۱۱،۱۲،.(۲۵ در یـــک دیـــد کلـــی تشــریح ســاختار جغرافیــایی درختــان جنگلــی از ایــن نظــر مهــم اســت کــه بســیاری از ایــن گونــههــا دارای گســتره جغرافیــایی وســیعی بــوده و تــوان بــالایی برای واگرایـی جغرافیـایی دارنـد. بـه عـلاوه، شـناخت ســـاختار ژنتیکــــی آنهــــا روی مـــدیریت اصـــلاح درختــان و برنامــههــای حفاظــت راش اثــر مــیگــذارد

.(۷)

از آنجــایی کــه تشــریح ســاختار جغرافیــایی درخــت راش بــرای ارائــه اســتراتژی هــای حفاظــت ژنتیکــی جنگلهـــای راش ضـــروری اســـت در ایـــن پـــژوهش سعی گردیـد برخـی یافتـه هـای اولیـه از نحـوه تمـایز

ژنتیکی راش معرفی گردد.

مواد و روشها

جوانـــههـــای خـــواب درختـــان راش از ۱۴ جمعیـــت طبیعــی راش موجــود در جنگلهــای هیرکــانی ایــران واقــع در شــیب شــمالی رشــتهکــوه البــرز جمــعآوری شــد ۳) ارتفــاع از هــر ایســتگاه: گرگــان از اســتان گلسـتان، نکـا، سـنگده و خیـرود از اسـتان مازنـدران، و اســالم از اســتان گـیلان کـه باختصــار بـا ارتفــاع و نــام هــر ایســتگاه در جــدول شــماره ۱ نشــان داده شده است).

کل DNA ژنومی از جوانههای خواب ۱۰۰) میلیگرم به عنوان ماده اولیه) ۶-۵ درخت در هر جمعیت با استفاده از کیت (Germany, Macherey Negel)

Nucleospin plant جداسازی گردید. دو قطعه ژنی

trnD-trnT و orf184-petA با استفاده از پرایمرهای اختصاصی کلروپلاستی(۹)DT و(۱۳)OA (جدول شماره (۲ و از طریق واکنش زنجیری پلی مراز((PCR

تکثیر شدند. محیط فرایند PCR با حجم نهایی ۲۰ l

شامل: mM 10 (pH 8/3) Tris- HCl ، ۵۰ KCL mM ، mM 1/5 MgCl2 ، ژلاتین (W/V ) % 0/001،

M 250 از هر داکسینوکلئوزیدتری فسفات (dNTP)، M 1 از هر پرایمر و ۱ واحد Taq DNA polymeras می باشد که پس از نگهداری محلول واکنش به مدت ۶۰ ثانیه در ۹۰ ° C، محلول واکنش طی۳ مرحله در معرض چرخههای مختلف دمایی زیر قرار گرفتند: ۵ (۱) چرخه: ۹۵ ° C به مدت ۳۰ ثانیه،

۶۰ ° C به مدت ۳۰ ثانیه، ۷۲ ° C به مدت ۴ دقیقه. ۵:(۲) چرخه: ۹۵ ° C به مدت ۳۰ ثانیه، ۵۵ ° C به مدت

۳۰ ثانیه، ۷۲ ° C به مدت ۴ دقیقه. ۲۵ :(۳) چرخه: ° C

۹۵ به مدت ۳۰ ثانیه، ۵۰ ° C به مدت ۳۰ ثانیه، ۷۲ ° C

به مدت ۴ دقیقه. سپس فرآوردههای تکثیر در ۷۲ ° C

به مدت ۱۰ دقیقه نگهداری شدند.

فـــرآوردههـــای تکثیـــر DT و ۱۵ µL) OA حـــاوی (DNA 1 mg بــه ترتیــب بــا ۵ واحــد آنــزیم محــدود

۱۱۸

مجله زیست شناسی ایران جلد ۱۷ ، شماره ۲، تابستان ۱۳۸۳

کننـــده HaeIII و HinfI، در حجـــم نهـــایی ۲۰ µL

در ۳۷ ° C بــه مــدت ۴ ســاعت تیمــار شــد. محصــول نهــایی بوســیله الکتروفــورز روی ژل پلــیاکریــلآمیــد غیــر تقلیبــی تعیــین تــرادف (W/V) %8 تجزیــه شــد.

قطعــات پلــیمورفیــک براســاس کــاهش طــول قطعــه در ژل پلــــیاکریــــلآمیــــد نــــامگــــذاری شــــدند.

هاپلوتایـپهـا براسـاس ترکیـب هـای مختلـف قطعـات پلــیمورفیــک شناســایی تعیــین شــد. گونــاگونی در دو قطعــه DT و OA مــورد بررســی بــه جهــشهــای نقطـــهای، یـــا حـــذف و اضـــافه بازهـــا نســـبت داده مــیشــود. ترکیــب ایــن متغیرهــا در هــر دو لوکــوس تعیـــین کننـــده یـــک هاپلوتایـــپ اســـت (صـــالحی شانجانی، .(۱۳۸۱

بـــرآورد عوامـــل تنـــوع ژنتیکـــی hs) و (ht و تمـــایز ژنتیکــی Gst) و (Nst در ژنــوم کلروپلاســـت بــا اســـــتفاده از روشهـــــای Pons و ۱۶) Petit،(۱۷ و

نــرمافــزار HAPLODIV انجــام شــد. بــر خــلاف Gst

کــه فقــط براســاس فراوانــی هاپلوتایــپهــا محاســبه میشـود، Nst شـباهت ژنتیکـی بـین هاپلوتایـپهـا را نیز بررسی میکند.

نتایج و بحث

بــرای بررســی گونــاگونی ژنتیکــی جمعیــت هــای راش ایـــران بـــا اســـتفاده از روش PCR-RFLP، دو قطعــه از cpDNA بــه نــامهــای DT و OA تکثیــر و تجزیــه شــدند. انــدازه منــاطق DT و OA بــه ترتیــب از ۱۶۶۱ تـــا ۱۶۶۴ جفـــت بـــاز و از ۲۸۸۹ تـــا ۲۸۹۳

جفــت بــاز متغیــر بــود Vettori) و همکــاران، .(۲۰۰۲

بــرای شناســایی هاپلوتایپهــای ایرانــی، نیمــرخ هضــم شـــده دو منطقـــه DT و OA بطـــور همزمـــان بـــا قطعــــات ناشــــی از هضــــم DNA شــــاهد یعنــــی هاپلوتایــپ شــناخته شــده از قبــل (توســط پرفســور IMGPF-CNR,Giannini، ایتالیـــا در اختیـــار قـــرار

گرفــت) مقایســه گردیــد (شــکل شــماره . (۱ در میــان افــراد هــر یــک از جمعیتهــای مــورد مطالعــه، قطعــات محـــدود کننـــده منطقـــه DT هـــیچ پلـــیمورفیســـمی نشــان نـــداد. در حـــالی کـــه در میـــان افـــراد درون جمعیتهــای مــورد مطالعــه منطقــه اســالم و جمعیــت نکــا- ۱۴۰۰، شــاهد وجــود پلــیمورفیســم در قطعــات محـــدود کننـــده منطقـــه OA بـــودیم. بـــا مقایســـه همزمــان نیمــرخهــای هضــم شــده منــاطق DT و OA

با قطعـات هضـم شـده DNA شـاهد، هاپلوتایـپهـای از قبــل شــناخته شــده، امکــان تعیــین متغیرهــای DT
و OA جمعیتهــــای راش ایــــران بدســــت آمــــد. در منطقــه DT بــه اســتثناء درختــان جمعیــت خیــرود-۶۰۰ که قطعه پلـیمـورفیکی بـه طـول ۴۹۸ جفـت بـاز داشــتند درختــان ســایر جمعیتهــای مــورد مطالعــه دارای قطعــه پلــیمورفیــک مشــابه ۴۹۶ جفــت بــازی بودنــد. طــول قطعــه پلــیمورفیــک در منطقــهOAدر یکـــی از درختـــان جمعیـــت نکـــا- ۱۴۰۰ و نیمـــی از درختــان جمعیتهــای منطقــه اســالم ۴۶۳ جفــت بــاز و در بــاقی درختــان جمعیتهــای مــورد مطالعــه ۴۶۲

جفـت بـاز بــود (جـدول شــماره .(۳ بــه عبــارت دیگــر پــس از تجزیــه بــا آنــزیمهــای محــدود کننــده، دو متغیــر در هــر یــک از منــاطق DT و OA یافــت شــد کـه بـا هـم بـه صـورت ۳ هاپلوتایـپ cpDNA ترکیـب شــــدند (هاپلوتایپهــــای شــــماره ۲، ۳ و .(۱۴

فــراوانتــرین هاپلوتایــپ، هاپلوتایــپ شــماره ۲ بــا فراوانــی ۰/۷۹ اســت کــه در تمــام گســترش پــراکنش راش واقـــع در جنگـــلهـــای هیرکـــانی غیـــر از یـــک

فراوانترین هاپلوتایپ در ال اروپا

و ال ایتالیا + ۲ عیت در بلغارستان (اطلاعات شفاهی دریافت شده از Giannini، ۲۰۰۲).

فراوانترین هاپلوتایپ در ال اروپا
و ال ایتالیا + ۲ فرد یک عیت در

بلغارستان (اطلاعات شفاهی دریافت شده
از Gianini، ۲۰۰۲).

یک عیت در ایران.

۱۱۹

مجله زیست شناسی ایران جلد ۱۷ ، شماره ۲، تابستان ۱۳۸۳

جمعیـــــت (خیـــــرود- (۶۰۰ وجـــــود دارد. یـــــک هاپلوتایـپ نسـبتاً نـادر نیـز (هاپلوتایـپ شـماره (۳ بـا فراوانـــی ۰/۱۰۲ در فـــرد یـــا افـــرادی از برخـــی جمعیــت هــای غــرب جنگــلهــای هیرکــانی (اســالم-۶۰۰، اســـالم- ۱۲۰۰ و اســـالم- (۱۹۰۰ یـــا در یـــک جمعیــت واقــع در مرکــز جنگــلهــای هیرکــانی (نکــا-(۱۴۰۰ مشــــاهده گردیـــد. هاپلوتایــــپ شـــماره ۱۴

انحصـــار بـــه جمعیـــت خیـــرود- ۶۰۰ دارد (شـــکل شـــــماره .(۲ توزیـــــع هاپلوتایپهـــــای PCR-RFLP

نشــان مــیدهــد کــه: (۱ فــراوان تــرین هاپلوتایــپ

(شـــماره (۲ بـــه اســـتثناء یـــک جمعیـــت در تمـــام جمعیــت هــا وجــود دارد، ۱۰ (۲ تــا از ۱۴ جمعیــت منومورفیـک هسـتند (بـا هاپلوتایـپ هـای شـماره ۲ و .(۱۴ این مشـاهدات نشـان مـیدهـد کـه تنـوع ژنتیکـی راش شـــرقی در ایـــران دارای ســـاختار جغرافیـــایی مــیباشــد (شــکل شــماره .(۳ مطالعــات بســیاری، ســاختار جغرافیــایی را بــرای گونـــاگونی cpDNA

در ســــطح زیــــر گونــــهای گــــزارش نمــــودهانــــد

۱۵)،۱۸،۱۱،۲۰،۲۴،۲۶،۱۴،۲۳،.(۳۶ بـــــــه عـــــــلاوه گونـــاگونی cpDNA درون گونـــهای راش اروپـــایی شــامل ۳) Fagusylvatica،(۷ گــزارش شــده اســت.
نتیجـــه حاصـــل از اکثـــر ایـــن مطالعـــات پیشـــنهاد مــیکنــد کــه وقــایع تــاریخی کلیــدی (مثــل وقــایع یخبنــدان) ســاختار جغرافیــایی گونــاگونی cpDNA

را شکل دادهانـد. آنهـا توزیـع گسـترده یـک هاپلوتیـپ

cpDNA منفــــرد را در شــــمال اروپــــا و چنــــدین هاپلوتایــپ را در جنــوب اروپــا تشــخیص دادنــد. در پــژوهش حاضــر، هاپلوتایــپ شــماره ۲ بــه اســتثناء جمعیــت خیــرود-۶۰۰ در تمــام جمعیــت هــا توزیــع شــده اســت. هاپلوتایــپ شــماره ۳ کــه بیشــتر در منــاطق غربــی مشــاهده مــیشــود ایــن منــاطق را از مناطق باقیمانده جـدا نمـود. چنـین تـوزیعی مـیتوانـد ناشــی از اختلافــات محیطــی بــه ویــژه در میــزان

بارنـدگی، رطوبـت هـوا، نـوع هومـوس خـاک و سـنگ مـــادر از شـــرق بـــه غـــرب باشـــد ۵)،۱،۲،.(۳ علـــت دیگری کـه مـیتـوان بـرای الگـو توزیـع هاپلوتایپهـای

cpDNA اســـتفاده نمـــود تاریخچـــه مهـــاجرت راش در طــــی توزیــــع تــــاریخی آن در دوران ســــوم از اســـالم (ناحیـــه بســـیار پلـــیمورفیـــک) بـــه شـــرق جنگلهای هیرکانی است.